Genómica funcional en E. coli: Caracterización experimental y modelación de la red de regulación transcripcional

Posdoctoral fellow: Dr. Luis Gerardo Treviño Quintanilla.

Nuestra línea de investigación se centra en caracterizar los sitios de unión, en las regiones promotoras de todo el genoma, de reguladores transcripcionales involucrados en la utilización de fuentes de carbono, fuentes de nitrógeno y crecimiento en aerobiosis/anaerobiosis en E. coli K-12 mediante la inmunoprecipitación de un complejo compuesto por fragmentos de DNA y el regulador transcripcional de interés marcado con un epítope y microarreglos. Además, estamos co labo rando con otros investigadores de nuestro grupo en la realización de proyectos experimentales-teóricos sobre la regulación transcripcional mediada por otros factores transcripcionales y/o factores sigma y su participación en la regulación jerárquica en E. coli . Por ultimo, participamos en la consolidación de un labo ratorio experimental en el departamento de Genómita Computacional del CCG dirigido por el Dr. Julio Collado Vides mediante la escritura de proyecto aprobado por la UNAM y el CONACYT para la realización y ampliación de la presente línea de investigación.