Programa de Genómica Funcional de Procariotes

Responsable del Programa: Jaime Mora-Celis, M. D. Ph. D.

Con genómica comparativa encontramos que en R.etli, S.meliloti, M.loti, A.tumefaciens y B.melitensis una alta proporción de sus genes cromosomales son sinténicos (conservan el orden) y en comparación con los no sinténicos muestran mayor organización en operones, restricción al cambio, esencialidad e interacción funcional. Los sinténicos muestran una proporción de residuos comunes y otra de propios (la firma de la especie). ¿Hay mayor interrelación evolutiva en los sinténicos?, ¿Cuál es el significado funcional de la firma de la especie? Para ello seguimos 2 líneas:

1) Analizamos los genes sinténicos y no sinténicos comunes en esos Rhizobiales por identidad, similitud y filogenia.
2) Mutagenizamos argC (sinténico esencial de la síntesis de arginina) en S.meliloti y lo sustituimos con el gene de los otros Rhizobiales para evaluar la influencia de las firmas en el ajuste enzimático, la restitución de la prototrofía y la formación de metabolones.

Además, en el Laboratorio de Proteómica se analizan el proteoma, fosfoproteoma y transcriptoma de R.etli y S.meliloti para determinar la expresión global del genoma en el metabolismo fermentativo y aeróbico, simbiosis, en condiciones de estrés y en desarrollo de biofilms, de una sola especie y en comunidad con eucariotes como S.cerevisiae. De igual forma, hemos iniciado proyectos de proteómica buscando factores específicos en cáncer cervicouterino, como biomarcadores en plasma de pacientes con esta patología, y cambios en el fosofoproteoma en líneas celulares de cáncer.

REPOSITORIO DE ARTÍCULOS SELECCIONADOS POR EL DR. JAIME MORA.

Los artículos que aparecen en esta sección, son una selección del Dr. Mora hecha a través de varios años y de diversas revistas. Cada artículo cuenta con el resumen (abstract) del mismo, así como una liga para obtener el documento en formato PDF.

En próximas fechas estará disponible una red interactiva de las palabras clave de cada uno de los artículos contenidos en el Repositorio. Se les mantendrá informados cuando esta herramienta se active.

El Repositorio se encuentra ubicado en la siguiente dirección:

• Rhizogenómica/lib

Rhizogenómica. Portal del Programa de Genómica Funcional de Procariotes, que dirige el Dr. Jaime Mora. Además de presentar información sobre los proyectos de investigación, en especial está dedicado a herramientas computacionales para el análisis genómico. Contiene los programas perl utilizados para la genómica comparativa de Rhizobiales, artículos publicados recientemente y otras ligas de interés.